Rev Hematol Oncol. 2025 Out 28;14(1):127. doi: 10.1186/s40164-025-00718-4.
RESUMO
Reconstruir e entender a heterogeneidade intra-tumoral, a coexistência de múltiplos subclones geneticamente distintos dentro do tumor de um paciente, e o desenvolvimento tumoral é essencial para resolver a carcinogênese e identificar mecanismos de resistência à terapia. Enquanto o sequenciamento em massa pode oferecer uma visão ampla da complexidade/heterogeneidade tumoral de um paciente, a análise de célula única continua sendo essencial para identificar subclones raros que podem impulsionar a resistência à quimioterapia. Neste estudo, realizamos uma análise integrada de dados de sequenciamento de DNA em massa e de células únicas de pacientes com leucemia mieloide aguda do fator de ligação central, definida pela presença de um gene de fusão RUNX1::RUNX1T1 ou CBFB::MYH11. Por sequenciamento de células únicas, inferimos filogenias tumorais para 8 pacientes no diagnóstico, incluindo variantes somáticas específicas do paciente, alterações somáticas no número de cópias e genes de fusão, e estudamos a evolução clonal sob a pressão da quimioterapia em 3 pacientes. Como resultado, desenvolvemos uma abordagem para integrar de forma confiável alterações somáticas subclonais no número de cópias em árvores filogenéticas e análise da evolução clonal, obtendo uma resolução sem precedentes da heterogeneidade intra-tumoral em CBF AML. Conseguimos mostrar que o gene de fusão está entre os primeiros eventos da leucemogênese em nível de célula única. Identificamos clones tumorais remanescentes em 6 pacientes com amostras de remissão completa, indicando erradicação incompleta dos clones tumorais. Aqui, mostramos que identificar a ordem de aquisição de mutações pode fornecer informações valiosas sobre a história evolutiva, oferecendo um quadro para melhorar a seleção de medicamentos na era das terapias direcionadas.
PMID:41152985 | DOI:10.1186/s40164-025-00718-4
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