J Mol Evol. 2025 dez 3. doi: 10.1007 / s00239-025-10289-x. Online antes da impressão.

RESUMO

Os introns mitocondriais têm uma distribuição irregular nas linhagens de esponjas. Aqui, relatamos a descoberta de um grupo-II-intron em Eunapius rarus (Demospongiae, Spongillidae), que constitui o primeiro relato de um intron mitocondrial em esponjas de água doce. Os group-II-introns são ribozimas de auto-esporulação e são particularmente raros entre os genomas mitocondriais de esponjas. O intron contém quadros de leitura abertos completos (ORFs), incluindo proteínas codificadas por intron típicas (IEPs). A análise filogenética revela que o intron está mais relacionado aos encontrados em algas castanhas e distante de outros group-II-introns de esponjas, indicando uma aquisição independente desse intron em relação a outras esponjas. Notavelmente, a congênere E. fragilis não possui esse intron em seu genoma mitocondrial. No entanto, encontramos cópias pseudogênicas do group-II-intron de E. rarus no genoma nuclear de E. fragilis, o que indica padrões de presença de group-II-intron e sua transposição de pseudogene para os genomas nucleares em esponjas pela primeira vez. Nossos resultados mostram que um group-II-intron deve ter estado presente no último ancestral comum de ambos os genomas mitocondriais de Eunapius e posteriormente perdido em E. fragilis, em vez de aquisição independente. Consequentemente, nossas descobertas fornecem uma explicação para a distribuição irregular de introns em esponjas como resultado de perdas frequentes, além de múltiplas aquisições.

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PMID: 41335200 | DOI: 10.1007/s00239-025-10289-x

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