Transcriptômica de célula única e espacial identifica COL6A3 como um biomarcador prognóstico em sarcoma pleomórfico indiferenciado.

Mol Cancer. 2024 Nov 15;23(1):257. doi: 10.1186/s12943-024-02168-8.

RESUMO

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O sarcoma pleomórfico indiferenciado (UPS) e tumores relacionados são o tipo mais comum de sarcoma de tecido mole. No entanto, esse espectro de tumores tem diferentes etiologias com taxas variadas de metástase e sobrevivência. Dois neoplasmas baseados na pele nesta classe de sarcomas pleomórficos, o fibroxantoma atípico (AFX) e o sarcoma pleomórfico dérmico (PDS), são desafiadores de diferenciar na biópsia inicial, mas variam significativamente em prognóstico. Realizamos transcriptômica de células únicas em cinco espécimes de biópsia de AFX e PDS, bem como transcriptômica de células únicas e espaciais em um espécime de excisão de PDS para caracterizar melhor esses tumores. Os genes diferenciais principais entre AFX e PDS foram preditivos da sobrevivência geral em outros 17 cânceres incluídos no Atlas de Proteínas Humanas. Destes genes, COL6A3 e BGN predisseram a sobrevivência geral e a sobrevivência livre de metástase em coortes independentes de 46 e 38 tumores de UPS, respectivamente. COL6A3 foi o mais preditivo da sobrevivência global em pacientes com UPS e superou um painel de genes prognósticos de sarcoma estabelecido na predição de metástase em UPS.

PMID: 39548577 | DOI: 10.1186/s12943-024-02168-8

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