Biomark Res. 2025 Jan 23;13(1):15. doi: 10.1186/s40364-024-00723-5.

RESUMO

A síndrome de Richter (RS), caracterizada por linfoma agressivo originado da leucemia linfocítica crônica (LLC), apresenta uma resposta pobre ao tratamento e prognóstico sombrio. Para elucidar os mecanismos da RS, amostras emparelhadas de um paciente com DLBCL-RS foram submetidas a sequenciamento RNA de células únicas (scRNA-seq) e sequenciamento de alta resolução de captura de cromossomo (Hi-C). Mais de 10.000 células foram perfiladas via scRNA-seq, revelando a transformação abrangente de células B na RS. O sequenciamento Hi-C expôs uma arquitetura única de cromatina na RS, com aumento de interações próximas e diminuição de interações distantes. Em escala de compartimentos, a interação entre compartimentos de células B foi fortalecida em células DLBCL, enquanto os domínios associativos topologicamente (TADs) em células DLBCL tiveram contatos elevados intra-TAD e reduzidos inter-TAD. Genes diferencialmente expressos nas bordas dos TADs entre células CLL e DLBCL destacaram um enriquecimento na sinalização mediada por cAMP. Para substantivar a relevância funcional de ATF1 e CAP1, os genes envolvidos na sinalização mediada por cAMP, no contexto de proliferação celular, foram realizados experimentos de ganho e perda de função em linhas celulares relevantes. Coletivamente, os dados integrados de scRNA-seq e Hi-C sugerem que a reorganização da cromatina e a sinalização de cAMP alterada impulsionam a transformação da RS.

PMID:39849544 | DOI:10.1186/s40364-024-00723-5